Nació el 28 de octubre de 1974 en San Juan (Puerto Rico). El hermano menor del malogrado actor River Phoenix ha llevado una irregular carrera que parece estar encontrando el norte. Sus padres estaban empeñados en convertir a sus guapos hijos en actores y, ya desde muy jóvenes, les sometieron a toda clase de castings.
River logró un triunfo tan prematuro como fugaz y Joaquin tuvo unos comienzos titubeantes, desapareciendo una temporada del panorama cinematográfico tras la trágica muerte de su hermano. A mediados de los noventa comienza a destacar como secundario de films interesantes, como Todo por un sueño, Regreso al paraíso o El secreto de los Abbott, donde conoció a la que sería su pareja durante casi tres años, la actriz Liv Tyler. Pero su mayor triunfo hasta la fecha ha sido su encarnación del emperador romano de Gladiator, que le valió una nominación al Oscar. Ha dado vida también al Marqués de Sade en Quills.
